Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP7AQ04656 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms