Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms