Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TOP2BQ02880 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms