Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms