Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDR2Q01850 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms