Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK3Q00526 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK3Q00526 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms