Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELF3P78545 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELF3P78545 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELF3P78545 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELF3P78545 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELF3P78545 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELF3P78545 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELF3P78545 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELF3P78545 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms