Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms