Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFM1P61960 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFM1P61960 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFM1P61960 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
UFM1P61960 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UFM1P61960 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms