Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms