Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP3P57721 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms