Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV3P56539 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV3P56539 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV3P56539 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV3P56539 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV3P56539 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV3P56539 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV3P56539 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV3P56539 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV3P56539 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV3P56539 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV3P56539 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAV3P56539 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAV3P56539 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV3P56539 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV3P56539 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV3P56539 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV3P56539 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV3P56539 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV3P56539 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV3P56539 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAV3P56539 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms