Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRPF1P55201 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms