Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC12A2P55011 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms