Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms