Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MVDP53602 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MVDP53602 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MVDP53602 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MVDP53602 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MVDP53602 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MVDP53602 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MVDP53602 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MVDP53602 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MVDP53602 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MVDP53602 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms