Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GBX2P52951 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GBX2P52951 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GBX2P52951 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms