Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSEN1P49768 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms