Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCAMP43121 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MCAMP43121 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms