Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FDFT1P37268 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FDFT1P37268 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms