Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHI3L1P36222 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms