Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC3AP31941 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms