Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRB3P28472 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABRB3P28472 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms