Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms