Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB4P28070 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms