Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms