Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB9P28065 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB9P28065 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms