Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTX3P26022 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTX3P26022 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTX3P26022 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTX3P26022 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTX3P26022 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms