Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTSSP25774 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms