Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ERBB3P21860 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERBB3P21860 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms