Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRHP20396 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRHP20396 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRHP20396 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRHP20396 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRHP20396 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRHP20396 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRHP20396 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRHP20396 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRHP20396 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRHP20396 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRHP20396 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRHP20396 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRHP20396 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRHP20396 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRHP20396 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRHP20396 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRHP20396 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRHP20396 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRHP20396 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRHP20396 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRHP20396 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRHP20396 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRHP20396 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRHP20396 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRHP20396 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRHP20396 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRHP20396 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRHP20396 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRHP20396 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRHP20396 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRHP20396 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRHP20396 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRHP20396 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRHP20396 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRHP20396 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRHP20396 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRHP20396 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRHP20396 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRHP20396 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRHP20396 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRHP20396 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRHP20396 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRHP20396 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRHP20396 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRHP20396 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRHP20396 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
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