Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
XBP1P17861 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
XBP1P17861 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
XBP1P17861 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
XBP1P17861 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms