Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSP16219 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSP16219 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSP16219 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSP16219 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSP16219 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSP16219 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSP16219 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSP16219 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSP16219 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSP16219 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSP16219 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSP16219 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACADSP16219 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ACADSP16219 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACADSP16219 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms