Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXB3P14651 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HOXB3P14651 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms