Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT10P13645 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRT10P13645 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT10P13645 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT10P13645 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT10P13645 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT10P13645 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT10P13645 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT10P13645 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT10P13645 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT10P13645 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT10P13645 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms