Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms