Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms