Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB5P09067 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms