Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPHP4O75161 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP4O75161 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP4O75161 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP4O75161 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP4O75161 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP4O75161 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP4O75161 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP4O75161 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPHP4O75161 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms