Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD2O60548 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD2O60548 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD2O60548 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD2O60548 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD2O60548 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD2O60548 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD2O60548 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD2O60548 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD2O60548 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD2O60548 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD2O60548 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD2O60548 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD2O60548 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD2O60548 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD2O60548 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms