Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPAG9O60271 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms