Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCA5O60264 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms