Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKAB2O43741 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms