Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRGAP3O43295 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms