Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SGSM2O43147 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGSM2O43147 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms