Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCF2LO15068 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms