Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASKO14936 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASKO14936 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASKO14936 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASKO14936 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASKO14936 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASKO14936 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASKO14936 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASKO14936 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASKO14936 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASKO14936 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASKO14936 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASKO14936 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASKO14936 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CASKO14936 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASKO14936 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASKO14936 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms