Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DFFAO00273 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DFFAO00273 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DFFAO00273 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DFFAO00273 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DFFAO00273 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DFFAO00273 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DFFAO00273 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DFFAO00273 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DFFAO00273 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms