Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD8-MDP1E9PL57 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEDD8-MDP1E9PL57 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms