Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPA5E9PKD4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms